Fakturace pro e-shopy: DPH, doprava, OSS a dobropisy v roce 2026

E-shop vystavuje daňový doklad (fakturu) obvykle až po zaplacení objednávky — u platby kartou, převodem i dobírkou. Na dokladu musí být zboží i doprava se správnou sazbou DPH (základní 21 %, snížená 12 % jen u vybraných druhů zboží), při prodeji koncovým zákazníkům do EU nad limitem řešíte DPH státu zákazníka (nejčastěji přes dobrovolný režim OSS) a při vratkách do 14 dnů vystavujete opravný daňový doklad (dobropis). EET je od roku 2023 zrušená, takže žádnou tržbu už neevidujete online. Níže najdete přesný postup, ukázkovou fakturu s výpočtem a nejčastější chyby, kterým se vyhnout.

Fakturace pro e-shopy v kostce

Oprávnění

Volná (obor Velkoobchod a maloobchod)

Výdajový paušál

60 % (max. 1,2 mil. Kč výdajů)

DPH

Plátcem se e-shop stává od 1. ledna po kalendářním roce s obratem nad 2 000 000 Kč, při překročení 2 536 500 Kč už den poté; sazbu zboží (21 nebo 12 %) určuje jeho zařazení.

Kdo platí

Spotřebitelé platící předem nebo dobírkou, část B2B odběratelů

Splatnost v praxi

Předem nebo při převzetí, B2B 7–14 dní

Pozor na

Předvánoční sezóna může obrat přehoupnout přes 2 536 500 Kč a plátcem jste pak hned od následujícího dne, ne až od ledna (§ 6 odst. 2).

Kdy a jaký doklad e-shop vystavuje

Na rozdíl od klasické firmy, která pošle fakturu se splatností, u e-shopu zákazník nejčastěji platí předem nebo při převzetí. Doklad proto obvykle není výzva k platbě, ale daňový doklad o už uskutečněné platbě.

Typický sled událostí:

1. Objednávka — zákazník dokončí košík a zvolí platbu (karta/platební brána, bankovní převod, dobírka).
2. Platba — u karty a brány proběhne hned, u převodu po připsání, u dobírky až při předání dopravcem.
3. Daňový doklad — vystavíte k okamžiku uskutečnění plnění, resp. přijetí platby, pokud platba předchází dodání.
4. Odeslání zákazníkovi — PDF e-mailem, případně v balíčku.

Povinné náležitosti daňového dokladu plátce DPH: označení dodavatele a odběratele, DIČ (u plátce), evidenční číslo dokladu, datum vystavení, datum uskutečnění zdanitelného plnění (DUZP), rozsah a předmět plnění, základ daně, sazbu a výši DPH. Neplátce DPH vystavuje jen fakturu bez daně (uvádí, že není plátcem).

Pozor na hranici DPH: k registraci k DPH vás nově posouvá obrat 2 000 000 Kč za kalendářní rok (stav 2025/2026). U rychle rostoucího e-shopu ji sledujte průběžně, konkrétní práh a okamžik registrace si ověřte, protože existuje i vyšší limit s okamžitým vznikem plátcovství.

DPH na zboží, dopravu, dobírku a zaokrouhlení

Sazby DPH v roce 2026: základní 21 % a jedna snížená 12 %. Naprostá většina spotřebního zboží v e-shopech (elektronika, oblečení, kosmetika, sport, doplňky) spadá do 21 %. Snížená 12 % se týká jen zboží, které splňuje konkrétní zařazení podle zákona — např. některé potraviny nebo léčiva. To, že je výrobek určený dětem, samo o sobě sníženou sazbu nezakládá; u dětského oblečení nebo hraček proto sazbu ověřte pro konkrétní výrobek. Knihy mají zvláštní režim; u konkrétní kategorie si sazbu vždy ověřte podle zákona o DPH, nespoléhejte na paušál.

Doprava a balné jsou tzv. vedlejší plnění a přebírají sazbu hlavního zboží. Když je celá objednávka v 21 %, je i poštovné v 21 %. Když jsou v košíku položky ve dvou sazbách, dopravu je nutné rozpočítat poměrně.

Dobírka: poplatek za dobírku, který přeúčtováváte zákazníkovi, je zdanitelné plnění a daníte ho stejnou logikou jako dopravu. Naopak samotné inkaso částky za zboží dobírkou není druhá tržba — daníte hodnotu objednávky, ne dvakrát.

Zaokrouhlení: rozdíl ze zaokrouhlení celkové částky (typicky na koruny) se u bezhotovostních plateb nedaní. Řešte ho jako samostatný řádek „zaokrouhlení", ať sedí základ daně.

Prodej do zahraničí: režim OSS a dovoz

Přeshraniční prodej je pro e-shopy nejčastější zdroj chyb. Rozhodující je, komu a odkud kam prodáváte.

Prodej koncovým zákazníkům (B2C) do jiných zemí EU — tzv. prodej zboží na dálku:

• Místo plnění zůstává v ČR, dokud tyto prodeje do EU dohromady s přeshraničními elektronickými, telekomunikačními a vysílacími službami nepřesáhnou 10 000 EUR v běžném ani v předchozím kalendářním roce (a platí i další zákonné podmínky). Jako plátce pak účtujete českou DPH jako běžně; neplátce kvůli tomu DPH účtovat nezačíná.
• Nad limitem je místem plnění stát zákazníka a řešíte tamní DPH (např. německou u dodání do Německa). Odvést ji můžete přes OSS (One Stop Shop), což je dobrovolné zjednodušení; jinou cestou je registrace a plnění povinností přímo v daném státě. Samotné překročení 10 000 EUR tedy povinnou registraci do OSS neznamená.

Prodej plátci DPH v jiném státě EU (B2B) s platným DIČ a dodáním do zahraničí je zpravidla osvobozené intrakomunitární dodání — na dokladu uvádíte odkaz na osvobození a hlásíte v souhrnném hlášení.

Dovoz zboží ze třetích zemí (typicky dropshipping z Asie) do 150 EUR na zásilku řeší zjednodušený režim IOSS. Pro tuto oblast doporučujeme konzultaci s účetní, protože pravidla se liší podle hodnoty i toku zboží.

Ukázková faktura e-shopu (s výpočtem DPH)

Modelová objednávka: běžecké boty za 2 500 Kč s dopravou přes výdejní místo za 80 Kč, plátce DPH, vše v sazbě 21 %.

Faktura — daňový doklad č. 2026000123 Dodavatel: Běhej s.r.o., IČO 12345678, DIČ CZ12345678 Odběratel: Jan Novák, Květná 5, Brno Datum vystavení i DUZP: 10. 7. 2026 · Forma úhrady: platební karta (uhrazeno)

Uhrazeno kartou dne 10. 7. 2026: 2 580,00 Kč. K úhradě zbývá: 0 Kč.

Protože je objednávka zaplacená předem, doklad nemá splatnost — je to potvrzení o platbě. Kdybyste prodávali velkoobchodně na fakturu (B2B), doplníte splatnost; obvyklá je 7–14 dní, u nových odběratelů klidně platba předem.

Dobropisy, vratky a reklamace

Vratky jsou u e-shopů běžné a mají vlastní pravidla. Spotřebitel může od smlouvy uzavřené na dálku odstoupit do 14 dnů bez udání důvodu. Když zboží vrátí a vy vracíte peníze:

• Vystavíte opravný daňový doklad (dobropis) navázaný na původní fakturu — nikdy původní doklad jen nemažte a nepřepisujte.
• Vracíte i uhrazené poštovné za doručení k zákazníkovi (nejlevnější nabízenou variantu). Náklady na vrácení zboží zpět nese při odstoupení do 14 dnů zpravidla zákazník.
• U částečné vratky (zákazník vrátí 1 ze 2 kusů) dobropisujete jen odpovídající část včetně poměru DPH.

U reklamací (vada zboží) je režim jiný než u odstoupení — řešíte opravu, výměnu nebo vrácení peněz podle uplatněných práv z vadného plnění, ale i tady se vratka peněz promítne opravným dokladem.

Dobré je vést vratky v číselné řadě opravných dokladů odděleně a párovat je na původní objednávku, ať máte v účetnictví i skladu pořádek.

Objednávka ze Shoptetu rovnou na doklad

Nejčastější chyby a doporučený workflow

Nejčastější chyby v e-shopové fakturaci:

• Špatná sazba DPH na dopravu — dopravu posuzujte podle zboží, které doručuje, ne natvrdo 21 %. U potravin ve 12 % to může být 12 %, u knih splňujících zákonné podmínky jde o osvobození s nárokem na odpočet; knihy automaticky do 12 % nezařazujte.
• Česká DPH i nad limitem pro EU — po překročení 10 000 EUR se dál účtuje česká DPH, místo aby se řešila DPH státu zákazníka (přes OSS, nebo registrací přímo v daném státě).
• Zapomenutý dobropis u vratek — smazání nebo přepis původní faktury místo opravného dokladu.
• Díry v číselné řadě — chybějící nebo duplicitní evidenční čísla dokladů.
• Odkazy na EET — evidence tržeb je od roku 2023 zrušená, na dokladech ani v pokladně už nemá co dělat.
• Nesprávný okamžik dokladu u dobírky — plnění nastává až při doručení, ne při objednávce.
• Nespárované platby — doklady bez navázané úhrady z brány/výpisu.

Doporučený workflow, který tyto chyby řeší: napojte e-shop (Shoptet, WooCommerce) na fakturační nástroj, který z objednávky vystaví fakturu nebo proformu (u proformy se po spárování platby daňový doklad vystaví sám), pošle PDF zákazníkovi, spáruje platbu z bankovního účtu a připraví podklady do účetnictví včetně dobropisů. Sazby DPH u zboží a dopravy a hranici pro OSS si nastavte a hlídejte v e-shopu a s účetní.

Přesně to dělá doklad.ai: propojíte e-shop na Shoptetu nebo WooCommerce, doklady se generují a rozesílají samy, platby se párují z bankovního účtu a vratky vyřešíte dobropisem na dvě kliknutí. Vyzkoušejte doklad.ai zdarma a zautomatizujte fakturaci svého e-shopu ještě dnes.

Časté dotazy

Související návody

• Fakturace pro plátce DPH
• Fakturace pro neplátce DPH
• Fakturace pro influencery a tvůrce obsahu
• Fakturace pro řidiče Bolt, Uber a Wolt
• Faktura po splatnosti
• Fio banka
• Fakturace pro všechny profese
• Všechny návody a integrace

Užitečné nástroje

• Ověření DIČ ve VIES
• AI kontrola faktury
• Kalkulačka DPH
• Generátor QR platby
• Kontrola čísla účtu
• Úrok z prodlení
• Všechny nástroje