Povinnosti podnikatele a pokuty za jejich zmeškání: přehled lhůt a sankcí

15. října 2026 · Redakce Doklad.ai · podnikani

Co hrozí za pozdní daňové přiznání, kontrolní hlášení, přehledy pro ČSSZ a zdravotní pojišťovnu, sbírku listin, skutečné majitele, EET 2.0 nebo neohlášenou změnu živnosti. Lhůty, výše pokut a paragrafy na jednom místě, ověřené k 15. 10. 2026.

Rychlá odpověď

Za zmeškané povinnosti se platí dvojím způsobem. Automaticky ze zákona vzniká pokuta za opožděné daňové přiznání, pevné pokuty za kontrolní hlášení, pokuta 1 000 Kč za papírové podání, které na výzvu nenahradíte elektronickým, penále z daně doměřené úřadem, úrok z prodlení a penále z pojistného. Úřad je jen vyměří nebo předepíše. Ostatní pokuty úřad ukládá podle okolností až do zákonného stropu, například za nepodaný přehled, za neregistraci k DPH, u sbírky listin, skutečných majitelů, živnostenského úřadu nebo evidence tržeb.

• Pozdní daňové přiznání: 0,05 % stanovené daně za každý den prodlení, nejvýše 5 % a 300 000 Kč. Pokuta nevzniká, když zpoždění nepřesáhne 5 pracovních dnů, a nepředepíše se, když vyjde pod 1 000 Kč (§ 250 daňového řádu).
• Kontrolní hlášení: 1 000 Kč za pozdní podání bez výzvy, 10 000 až 50 000 Kč po výzvě. Fyzické osoby, čtvrtletní plátci a s.r.o. s jediným společníkem, který je fyzickou osobou, platí u pokut po výzvě polovinu (§ 101h zákona o DPH).
• Doměřená daň: penále 20 % z doměřené daně. Když chybu opravíte sami dodatečným přiznáním, penále nevzniká (§ 251 daňového řádu).
• Pozdní platba: úrok z prodlení u daní a penále u pojistného ve výši repo sazby ČNB zvýšené o 8 procentních bodů ročně.
• Přehled pro ČSSZ nebo zdravotní pojišťovnu: pokuta až 50 000 Kč, a když přehled nepodáte ani na výzvu, odhadne pojistné úřad.
• Účetní závěrka ve sbírce listin: když neuposlechnete výzvy rejstříkového soudu, hrozí pořádková pokuta až 100 000 Kč (§ 104 zákona č. 304/2013 Sb.). Při opakovaném neplnění může soud zahájit řízení o zrušení firmy s likvidací (§ 105). Finanční úřad může navíc uložit pokutu až 3 % aktiv (§ 37a zákona o účetnictví).
• Skutečný majitel: dokud není zapsán, nesmí mu s.r.o. vyplatit podíl na zisku a on nesmí hlasovat (§ 53 a 54 zákona č. 37/2021 Sb.). Pokuta až 500 000 Kč hrozí, když firma nezajistí zápis ani v lhůtě, kterou jí stanoví soud (§ 55).

Přehled: povinnost, lhůta, sankce

Zákony: daňový řád (č. 280/2009 Sb.), zákon o DPH (č. 235/2004 Sb.), zákony o pojistném (č. 589/1992 Sb. a č. 592/1992 Sb.), zákon o účetnictví (č. 563/1991 Sb.), zákon o veřejných rejstřících (č. 304/2013 Sb.), zákon o evidenci skutečných majitelů (č. 37/2021 Sb.), živnostenský zákon (č. 455/1991 Sb.), zákon o evidenci tržeb (č. 180/2026 Sb.), zákon o dani z nemovitých věcí (č. 338/1992 Sb.) a zákon o dani silniční (č. 16/1993 Sb.). Konkrétní paragrafy uvádíme v kapitolách níže.

1. Daně: přiznání, platby a kontrolní hlášení

Pozdní daňové přiznání

Lhůta pro roční přiznání je 3 měsíce po skončení roku. Prodlužuje se na 4 měsíce, když přiznání podáte elektronicky, a na 6 měsíců, když ho podává daňový poradce nebo máte povinný audit (§ 136 daňového řádu). Přiznání k DPH podávají plátci do 25 dnů po skončení měsíce nebo čtvrtletí (§ 136 odst. 4).

Když lhůtu zmeškáte, vzniká pokuta za opožděné tvrzení daně (§ 250 daňového řádu):

• 0,05 % stanovené daně (u daňového odpočtu 0,05 %, u ztráty 0,01 %) za každý den prodlení, nejvýše 5 % a nejvýše 300 000 Kč,
• vzniká, jen když zpoždění přesáhne 5 pracovních dnů,
• když vyjde pod 1 000 Kč, nepředepíše se,
• je poloviční, když přiznání podáte do 30 dnů po lhůtě a v témže roce u vás úřad nezjistil jiné prodlení s daňovým tvrzením,
• když přiznání nepodáte vůbec, počítá se rovnou horní hranice a pokuta je vždy aspoň 500 Kč.

Příklad (vlastní výpočet): daň z příjmů 300 000 Kč a přiznání podané 20 dní po lhůtě. Pokuta je 0,05 % × 300 000 Kč × 20 dní = 3 000 Kč. Protože jste ho podali do 30 dnů a jde o první prodlení v roce, zaplatíte polovinu, tedy 1 500 Kč. Základem je celá stanovená daň, ne doplatek po zaplacených zálohách (§ 250 odst. 8).

Když přiznání podáte a ke zpoždění vedl důvod, který lze ospravedlnit, můžete požádat o prominutí pokuty. Úřad přihlédne i k vašim ekonomickým a sociálním poměrům (§ 259aa daňového řádu).

Podnikatelé a firmy mají datovou schránku zřízenou ze zákona, takže daňová přiznání, přihlášky k registraci i oznámení změn podávají jen elektronicky. Platí to i pro zástupce s datovou schránkou (§ 72 odst. 6 daňového řádu). Když pošlete papír a vadu na výzvu neodstraníte, vzniká pokuta 1 000 Kč. Pokud tím závažně ztížíte správu daní, může ji úřad zvýšit až na 50 000 Kč (§ 247a odst. 2 a 4).

Pozdní platba daně

Daň z příjmů je splatná v poslední den lhůty pro řádné přiznání (§ 135 odst. 3 daňového řádu). Z daně zaplacené po splatnosti platíte úrok z prodlení, a to od čtvrtého dne po splatnosti do dne platby (§ 252). Výše odpovídá úroku z prodlení podle občanského zákoníku, tedy repo sazbě ČNB zvýšené o 8 procentních bodů ročně (§ 252 odst. 4 daňového řádu, § 2 nařízení vlády č. 351/2013 Sb.). U daní se bere repo sazba platná k prvnímu dni každého kalendářního pololetí, do kterého daný den prodlení spadá (§ 251a odst. 5). Úrok se nepředepíše, pokud u jedné daně za jedno zdaňovací období nepřesáhne 1 000 Kč (§ 251a odst. 2). O prominutí úroku můžete požádat, když už jste daň zaplatili a prodlení má ospravedlnitelný důvod (§ 259b).

Doměřená daň: penále 20 %

Když vám finanční úřad daň doměří, typicky po kontrole, vzniká automaticky penále 20 % z doměřené daně. Stejně 20 % platí ze sníženého daňového odpočtu a 1 % ze snížené daňové ztráty (§ 251 odst. 1 daňového řádu). Penále nevzniká, když se daň doměří na základě přípustného dodatečného přiznání, které jste podali sami (§ 251 odst. 4).

Zjistíte-li, že daň má být vyšší, podejte dodatečné přiznání a rozdíl doplaťte do konce měsíce následujícího po měsíci, ve kterém jste chybu zjistili (§ 141 odst. 1). Když už penále vzniklo a daň jste zaplatili, můžete do 3 měsíců od právní moci platebního výměru požádat o jeho prominutí. Podle míry vaší součinnosti může úřad prominout až 75 %, z ospravedlnitelného důvodu i celé penále (§ 259a).

Kontrolní hlášení

Plátce DPH, který je právnickou osobou, podává kontrolní hlášení vždy za kalendářní měsíc do 25 dnů po jeho skončení, i když je čtvrtletním plátcem. Fyzická osoba ho podává ve lhůtě pro přiznání k DPH (§ 101e zákona o DPH). Pokuty v prvních čtyřech řádcích tabulky vznikají přímo ze zákona (§ 101h odst. 1), pokuty v posledních dvou úřad ukládá podle okolností (§ 101h odst. 3 a 4):

Pokuty po výzvě (10 000, 30 000 a 50 000 Kč) jsou poloviční pro fyzické osoby, čtvrtletní plátce a s.r.o. s jediným společníkem, který je fyzickou osobou (§ 101h odst. 2). Tolerance 5 pracovních dnů jako u přiznání tu zákon nestanoví. O prominutí pokut po výzvě můžete požádat do 3 měsíců od právní moci platebního výměru, pokud k nepodání došlo z ospravedlnitelného důvodu (§ 101k); na pokutu 1 000 Kč se toto prominutí nevztahuje. Postup podání najdete v článku Kontrolní hlášení DPH.

Registrace a výzvy úřadu

• Nepodaná přihláška k registraci k DPH (do 10 pracovních dnů ode dne překročení obratu, § 94 odst. 1 zákona o DPH), jako identifikovaná osoba a u dalších registračních nebo oznamovacích povinností: pokuta až 500 000 Kč (§ 247a odst. 1 daňového řádu). Dražší ale bývá samotná daň. Plátcem se stáváte ze zákona dnem podle § 6 zákona o DPH i bez registrace, takže DPH z plnění od tohoto dne musíte přiznat a zaplatit, i když jste ji zákazníkům neúčtovali. K tomu běží pokuty za pozdní přiznání a kontrolní hlášení a úrok z prodlení. Lhůty k DPH shrnuje článek Kdy se stanu plátcem DPH.
• Ignorovaná výzva finančního úřadu ke splnění procesní povinnosti nepeněžité povahy, například k předložení dokladů, kterou bez dostatečné omluvy nesplníte ve lhůtě: pořádková pokuta až 500 000 Kč, pokud tím závažně ztěžujete nebo maříte správu daní (§ 247 odst. 2).

2. Pojistné: přehledy a zálohy

Přehled pro ČSSZ

OSVČ, jejíž daň se nerovná paušální dani, podává přehled o příjmech a výdajích do jednoho měsíce od uplynutí lhůty pro daňové přiznání (§ 15 odst. 1 zákona č. 589/1992 Sb.). OSVČ s datovou schránkou ho podává jen elektronicky (§ 123e odst. 4 zákona č. 582/1991 Sb.). Kdo přehled nepodá, dopouští se přestupku s pokutou až 50 000 Kč (§ 25c zákona č. 589/1992 Sb.). Když ho nepodáte ani ve lhůtě z písemné výzvy, může správa sociálního zabezpečení stanovit pravděpodobnou výši pojistného. Nemá-li podklady, počítá s měsíčním příjmem ve výši 1,5násobku průměrné mzdy (§ 22b).

Zahájení nebo ukončení samostatné činnosti oznamujete správě sociálního zabezpečení do 15 dnů (§ 48 odst. 4 zákona č. 582/1991 Sb.). Neoznámení je přestupek s pokutou až 10 000 Kč (§ 54 odst. 2 písm. c) a odst. 6 písm. a)).

Přehled pro zdravotní pojišťovnu

Přehled podáváte všem pojišťovnám, u kterých jste v roce byli pojištěni, rovněž do jednoho měsíce od lhůty pro daňové přiznání a jen elektronicky (§ 24 odst. 2 a 7 zákona č. 592/1992 Sb.). Za nepodaný přehled může pojišťovna uložit pokutu až 50 000 Kč (§ 26 odst. 1) a také stanovit pravděpodobnou výši pojistného (§ 25a). Neoznámené zahájení podnikání (do 8 dnů) může stát pojištěnce až 10 000 Kč (§ 44b zákona č. 48/1997 Sb.).

Pozdě zaplacené zálohy a doplatky

Z nezaplacených nebo nízkých záloh platíte penále ve výši úroku z prodlení podle občanského práva, tedy repo sazby zvýšené o 8 procentních bodů ročně (§ 20 zákona č. 589/1992 Sb. a § 18 zákona č. 592/1992 Sb.).

• Doplatek pojistného za uplynulý rok je splatný do 8 dnů po dni, kdy jste podali nebo měli podat přehled, u sociálního i zdravotního pojištění (§ 14a odst. 3 zákona č. 589/1992 Sb., § 8 odst. 5 zákona č. 592/1992 Sb.). Od dalšího dne běží penále.
• U sociálního pojištění se penále neplatí, když zálohu zaplatíte do konce kalendářního měsíce následujícího po splatnosti (§ 20 odst. 3 písm. b) zákona č. 589/1992 Sb.).
• U zdravotního pojištění se penále nepředepíše, když za rok nepřesáhne 200 Kč (§ 18 odst. 4 zákona č. 592/1992 Sb.).

Zálohy a jejich výši rozebírá článek Sociální a zdravotní pojištění OSVČ.

3. Firmy: sbírka listin a skuteční majitelé

Účetní závěrka ve sbírce listin

S.r.o. a další firmy zapsané v obchodním rejstříku zveřejňují účetní závěrku jejím uložením do sbírky listin (§ 21a zákona o účetnictví a § 66 písm. c) zákona o veřejných rejstřících). Uložit ji musí nejpozději do 12 měsíců od rozvahového dne, firmy s povinným auditem do 30 dnů od ověření a schválení (§ 21a odst. 2 a 4 zákona o účetnictví). Závěrku za kalendářní rok 2025 tedy nejpozději do 31. 12. 2026. Firmy, které nemusí mít audit, mohou podle velikosti vynechat výkaz zisku a ztráty (§ 21a odst. 9). Kdo závěrku neuloží:

• riskuje pořádkovou pokutu až 100 000 Kč, když neuposlechne výzvy rejstříkového soudu (§ 104 zákona o veřejných rejstřících),
• při opakovaném neplnění může soud i bez návrhu zahájit řízení o zrušení firmy s likvidací; předtím ji upozorní a dá jí přiměřenou lhůtu (§ 105),
• dopouští se přestupku podle zákona o účetnictví s pokutou až 3 % hodnoty aktiv celkem, kterou ukládá finanční úřad (§ 37a odst. 1 písm. n) a odst. 4 písm. b) a § 37ab zákona o účetnictví).

Více o uzávěrce v článku Účetní uzávěrka.

Skutečný majitel

Firma musí zajistit, aby údaje o jejím skutečném majiteli odpovídaly skutečnosti. Návrh na zápis podává bez zbytečného odkladu po vzniku rozhodné skutečnosti (§ 9 odst. 1 zákona č. 37/2021 Sb.).

U s.r.o., kde je fyzická osoba zapsána v obchodním rejstříku jako společník s podílem větším než 25 %, se tento společník do evidence propíše automaticky a má se za to, že firma povinnost splnila (§ 38 odst. 1 a § 9 odst. 2). Návrh tak podáváte sami hlavně tehdy, když se nikdo nepropíše, například nikdo nemá podíl nad 25 %, nebo když je skutečným majitelem někdo jiný, než kdo je zapsán. Stav si ověřte v evidenci skutečných majitelů.

Nezapsaný skutečný majitel má tvrdé důsledky:

• obchodní korporace mu nesmí vyplatit podíl na zisku. Když ho nevyplatí do konce účetního období, ve kterém o výplatě rozhodla, právo na podíl zaniká (§ 53),
• nesmí hlasovat na valné hromadě ani rozhodovat jako jediný společník (§ 54),
• pokuta až 500 000 Kč hrozí, když firma nezajistí zápis ani v přiměřené lhůtě, kterou jí stanoví soud (§ 55).

Jak zápis udělat, popisuje článek Evidence skutečných majitelů.

4. Živnostenský úřad a provozovna

• Změny údajů uvedených při ohlášení živnosti oznamujete do 15 dnů a dokládáte je. Neplatí to pro změny, které už jsou zapsané v základních registrech nebo v obchodním rejstříku (§ 49 odst. 1 živnostenského zákona). Za neoznámení hrozí pokuta až 20 000 Kč (§ 62 odst. 1 písm. w) a odst. 4 písm. e).
• Provozovnu musíte živnostenskému úřadu oznámit předem, a to zahájení i ukončení provozování živnosti v ní. Zahájení neoznamujete u automatů, mobilních provozoven a provozovny uvedené už v ohlášení živnosti (§ 17 odst. 3). Provozovna musí být zvenku označena jménem nebo firmou a IČO, provozovna pro spotřebitele navíc jménem odpovědné osoby a provozní dobou (§ 17 odst. 7 a 8). Za porušení hrozí pokuta až 100 000 Kč (§ 62 odst. 1 písm. e) a g) a odst. 4 písm. c).
• Podnikání bez živnostenského oprávnění stojí fyzickou osobu i firmu až 500 000 Kč u živnosti volné, 750 000 Kč u řemeslné nebo vázané a 1 000 000 Kč u koncesované (§ 61 odst. 3 a 4, § 63).

5. Evidence tržeb od 1. ledna 2027

Kdo bude od roku 2027 přijímat kontaktní platby, tedy hotovost a platby při osobním kontaktu nebo v provozovně, musí je evidovat. Neplatí to pro paušalisty v prvním pásmu přihlášené k EET OFF (§ 11 odst. 3 zákona č. 180/2026 Sb.). Připravit se musíte předem. Od 1. listopadu 2026, nejpozději ale před první evidovanou tržbou, oznámíte přes daňovou informační schránku všechny své evidenční jednotky, přes které máte tržby (provozovny, e-shop, vozidla), a získáte certifikát pro evidenci tržeb (§ 3, 14, 15 a 29 zákona č. 180/2026 Sb.). Tržbu pak evidujete nejpozději při jejím uskutečnění. Při výpadku spojení údaje došlete nejpozději do 48 hodin (§ 16 a 20).

Podnikatel, který neodešle údaje o evidované tržbě, se dopouští přestupku s pokutou až 500 000 Kč. Stejný strop platí pro závažné ztěžování nebo maření evidence (§ 23 a 24). Přestupky řeší finanční úřad, příkazem na místě je může pokutovat i celní úřad (§ 25). Kdo evidovat nemusí a jak funguje EET OFF, vysvětluje článek EET 2.0 od 1. 1. 2027.

6. Zaměstnavatelé

Zaměstnavatel plní většinu ohlašovacích povinností přes jednotné měsíční hlášení zaměstnavatele (JMHZ, zákon č. 323/2025 Sb.). Pokuty za jeho porušení stanoví § 28 tohoto zákona:

• zaměstnanec nepřihlášený do evidence zaměstnanců včas, tedy nejpozději před nástupem do práce: až 100 000 Kč,
• zaměstnavatel nepřihlášený do evidence zaměstnavatelů (nejpozději 2 pracovní dny před nástupem prvního zaměstnance): až 100 000 Kč,
• pozdě podané měsíční hlášení (podává se od 1. do 20. dne následujícího měsíce, § 7 odst. 1): až 5 000 Kč za každého zaměstnance v evidenci,
• neoznámená změna údajů o zaměstnanci (do 8 dnů): až 20 000 Kč,
• zaměstnanec neodhlášený do 8 dnů od skončení zaměstnání (§ 19 odst. 6): až 50 000 Kč.

Zdravotní pojišťovně oznamuje zaměstnavatel nástup zaměstnance do 8 dnů, u zaměstnance jen na DPP nebo DPČ do 20. dne měsíce následujícího po měsíci, kdy se stal plátcem pojistného. Za nesplnění oznamovací povinnosti mu pojišťovna může uložit pokutu až 200 000 Kč (§ 10 odst. 1 a § 44b odst. 1 zákona č. 48/1997 Sb.). U zákonného pojištění odpovědnosti zaměstnavatele se nezaplacené pojistné zvyšuje o 10 % za každý započatý měsíc prodlení (§ 12 odst. 9 vyhlášky č. 125/1993 Sb.). Celý postup popisuje článek První zaměstnanec: checklist.

Jak sankcím předejít

1. Termíny do kalendáře. Daňový kalendář na celý rok najdete v článku Daňový kalendář 2027.
2. Datovou schránku sledujte. Výzva úřadu, kterou neotevřete, se považuje za doručenou desátým dnem a lhůty běží. Víc v článku Datová schránka pro podnikatele.
3. Zmeškáte-li lhůtu, podejte co nejdřív. U přiznání máte toleranci 5 pracovních dnů. Do 30 dnů po lhůtě platíte poloviční pokutu, pokud u vás úřad v témže roce nezjistil jiné prodlení s daňovým tvrzením (§ 250 odst. 1 a 7). U kontrolního hlášení žádná tolerance neplatí.
4. Plaťte i bez přiznání. Daň je splatná poslední den lhůty pro řádné přiznání. Úrok z prodlení vzniká od čtvrtého dne po splatnosti bez ohledu na to, kdy přiznání podáte (§ 135 odst. 3 a § 252 odst. 2 písm. a) daňového řádu).
5. Chybu opravte sami. Přípustné dodatečné přiznání, které podáte sami, vás ušetří penále 20 % z doměřené daně (§ 251 odst. 4). Podejte ho do konce měsíce následujícího po zjištění chyby (§ 141 odst. 1); vyplatí se i po této lhůtě, protože pak hrozí jen pokuta za opožděné tvrzení (§ 250).
6. O prominutí požádejte včas. Penále z doměřené daně vám po zaplacení daně úřad může snížit až o 75 % podle toho, jak jste při kontrole spolupracovali, z ospravedlnitelného důvodu i celé; žádost podejte do 3 měsíců od právní moci platebního výměru (§ 259a). Pokutu za opožděné přiznání (§ 259aa daňového řádu), pokuty za kontrolní hlášení po výzvě (§ 101k zákona o DPH, do 3 měsíců od právní moci platebního výměru) a úrok z prodlení (§ 259b) lze prominout jen z ospravedlnitelného důvodu. Příslušenství daně úřad nepromine, pokud vy nebo člen vašeho statutárního orgánu v posledních 3 letech závažně porušil daňové nebo účetní předpisy (§ 259c).

Vše podstatné pro podnikatele shrnuje Průvodce podnikatele. Co stihnout do konce roku, najdete v checklistu na konec roku 2026.

Zdroje

• Zákon č. 280/2009 Sb., daňový řád, § 72, § 135, § 136, § 141, § 247, § 247a, § 250, § 251, § 251a, § 252, § 259a, § 259aa, § 259b a § 259c: e-sbirka.cz
• Zákon č. 235/2004 Sb., o dani z přidané hodnoty, § 6, § 94, § 101e, § 101h a § 101k: e-sbirka.cz
• Nařízení vlády č. 351/2013 Sb. (výše úroku z prodlení), § 2: e-sbirka.cz
• Zákon č. 589/1992 Sb., o pojistném na sociální zabezpečení, § 14a, § 15, § 20, § 22b a § 25c: e-sbirka.cz
• Zákon č. 582/1991 Sb., o organizaci a provádění sociálního zabezpečení, § 48, § 54 a § 123e: e-sbirka.cz
• Zákon č. 592/1992 Sb., o pojistném na veřejné zdravotní pojištění, § 8, § 18, § 24, § 25a a § 26: e-sbirka.cz
• Zákon č. 48/1997 Sb., o veřejném zdravotním pojištění, § 10 a § 44b: e-sbirka.cz
• Zákon č. 563/1991 Sb., o účetnictví, § 21a, § 37a a § 37ab: e-sbirka.cz
• Zákon č. 304/2013 Sb., o veřejných rejstřících, § 66, § 104 a § 105: e-sbirka.cz
• Zákon č. 37/2021 Sb., o evidenci skutečných majitelů, § 9, § 38, § 53, § 54 a § 55: e-sbirka.cz
• Zákon č. 455/1991 Sb., živnostenský zákon, § 17, § 49, § 61, § 62 a § 63: e-sbirka.cz
• Zákon č. 180/2026 Sb., o evidenci tržeb, § 3, § 11, § 14 až 16, § 20, § 23 až 25 a § 29: psp.cz
• Zákon č. 323/2025 Sb., o jednotném měsíčním hlášení zaměstnavatele, § 7, § 17, § 19 a § 28: e-sbirka.cz
• Vyhláška č. 125/1993 Sb. (zákonné pojištění odpovědnosti zaměstnavatele), § 12: e-sbirka.cz
• Zákon č. 338/1992 Sb., o dani z nemovitých věcí, § 13a, a zákon č. 16/1993 Sb., o dani silniční, § 2 a § 15: e-sbirka.cz

Aktuálnost ověřena: 15. 10. 2026. Výše pokut jsme ověřili v platném znění zákonů k tomuto dni. U pokut „až do“ rozhoduje úřad podle okolností, uvedená částka je zákonný strop. Článek je obecný přehled, ne individuální daňové nebo právní poradenství.