Faktura jednateli a vlastní s.r.o.: kdy fakturovat jde a kdy ne

Scénář „faktura jednateli / vlastní s.r.o." se objevuje v několika typických podobách:

• Jste jednatel a zároveň OSVČ a chcete své s.r.o. fakturovat konkrétní práci (vývoj, grafika, konzultace), místo abyste si vypláceli odměnu jednatele nebo mzdu.
• Máte dvě firmy — jedna poskytuje službu druhé, ve které jste rovněž jednatelem či společníkem (např. holdingové uspořádání, provozní a majetková společnost).
• Rozjíždíte s.r.o. a řešíte, jak si z ní legálně vzít peníze: odměna jednatele, mzda, podíl na zisku, nebo faktura za služby.
• Jste společník bez pracovní smlouvy, který pro firmu reálně pracuje na zakázkách mimo řízení společnosti.

Ve všech případech je klíčová jedna otázka: jde o výkon funkce jednatele, nebo o samostatnou službu? Odpověď určuje, zda vůbec smíte fakturovat a jaký daňový a odvodový režim se použije.

Vztah mezi jednatelem a společností při výkonu funkce se řídí zákonem o obchodních korporacích, ne obchodní (dodavatelskou) smlouvou. Obchodní vedení firmy proto nelze fakturovat — odměna za funkci se sjednává ve smlouvě o výkonu funkce schválené valnou hromadou (jinak je funkce ze zákona bezplatná).

Co spadá pod výkon funkce a na fakturu nepatří:

• obchodní vedení a organizace chodu společnosti,
• jednání za společnost navenek (podpisy smluv, zastupování),
• vedení účetní evidence po organizační stránce, svolávání valné hromady,
• strategické řízení a rozhodování jednatele.

Daňový režim odměny jednatele: jde o příjem ze závislé činnosti podle § 6 ZDP. Odměnu zdaňuje společnost jako plátce (záloha na daň 15 %, u vysokých příjmů 23 %), odvádí se z ní zdravotní pojištění vždy a sociální pojištění, pokud odměna dosáhne rozhodné částky pro účast na nemocenském pojištění. Přesné hranice a sazby pro rok 2026 si ověřte u účetní nebo na webu ČSSZ a VZP — mění se každý rok.

Pokud pro firmu děláte činnost, která věcně nesouvisí s řízením společnosti a dělal by ji stejně tak externí dodavatel, můžete ji své s.r.o. fakturovat — jako OSVČ nebo přes jinou firmu. Příklady: naprogramování e-shopu, správa PPC kampaní, právní či daňové poradenství (máte-li oprávnění), stavební práce, pronájem vlastního vybavení.

Musí být ale splněno:

• Reálné plnění — služba se skutečně poskytla, je doložitelná (výstup, výkaz práce, předávací protokol). Fiktivní faktura je daňový podvod.
• Cena obvyklá. S vlastní s.r.o. jste spojené osoby. Podle § 23 odst. 7 zákona o daních z příjmů musí cena mezi spojenými osobami odpovídat ceně, jakou byste sjednali s nezávislým subjektem. Nadhodnocená faktura (odčerpání zisku) i podhodnocená faktura může vést k doměření daně.
• Živnostenské/jiné oprávnění na danou činnost, pokud ho obor vyžaduje.
• Oddělitelnost od funkce jednatele. Čím blíž je služba k obchodnímu vedení, tím větší riziko, že finanční úřad plnění překvalifikuje na odměnu jednatele.

Dobře nastavená fakturace je legální a běžná. Hraniční je jen tehdy, když se za „službu" fakticky schovává výkon funkce nebo běžná závislá práce.

Oba jste čeští plátci DPH (nejčastější případ). Fakturuje se v běžném tuzemském režimu s českou DPH — základní sazba 21 %, snížená 12 % podle druhu plnění. Vaše s.r.o. si odpočte DPH na vstupu, pokud plnění použije pro svou ekonomickou činnost s nárokem na odpočet.

Pozor na § 36a — cena obvyklá i pro DPH. Protože jste se svou s.r.o. spojené osoby, u plnění, kde příjemce nemá plný nárok na odpočet (např. firma má i osvobozená plnění), se základ daně stanoví z ceny obvyklé, ne z ceny na faktuře. Pokud má vaše s.r.o. plný nárok na odpočet, tato korekce se typicky neuplatní, ale arm's-length cenu hlídejte kvůli dani z příjmů vždy.

Jste neplátce (OSVČ) a s.r.o. je plátce. Fakturujete bez DPH. Hlídejte si obrat: při překročení 2 000 000 Kč za 12 po sobě jdoucích měsíců vám vzniká povinnost registrace k DPH. Fakturace vlastní firmě se do obratu započítává.

Přeshraniční varianty (dle sídla stran):

• Jste OSVČ/firma v jiném státě EU a fakturujete české s.r.o. — u služeb podle základního pravidla (§ 9) je místo plnění tam, kde sídlí příjemce. Fakturujete bez DPH s režimem přenesení daňové povinnosti (reverse charge), českou daň si přizná a odvede vaše s.r.o.
• České s.r.o. jako příjemce služby ze třetí země (mimo EU) — obvykle rovněž reverse charge na straně příjemce.
• Fakturujete z ČR do zahraničí — místo plnění a povinnost se řídí sídlem odběratele a typem plnění.

Přeshraniční řetězce a zvláštní plnění (nemovitosti, doprava, digitální služby) mají odchylná pravidla — u konkrétního případu doporučujeme ověření s účetní.

Faktura vlastní s.r.o. má stejné náležitosti jako každý jiný daňový doklad. Nezapomeňte na:

• označení dodavatele i odběratele včetně IČO a DIČ obou stran,
• evidenční číslo dokladu, datum vystavení, datum uskutečnění zdanitelného plnění (DUZP) a datum splatnosti,
• rozsah a předmět plnění popsaný konkrétně (ne jen „služby"),
• jednotkovou cenu, základ daně, sazbu a výši DPH (u plátce), celkovou částku,
• u reverse charge větu „daň odvede zákazník".

Ukázkový příklad (oba plátci DPH, tuzemsko):

Jste jednatel firmy Alfa s.r.o. a zároveň OSVČ – programátor. Firmě jste naprogramoval interní aplikaci. Obvyklá tržní cena takové zakázky je 100 000 Kč.

• Předmět: „Vývoj interní skladové aplikace dle zadání ze dne …, 80 hodin"
• Základ daně: 100 000 Kč
• DPH 21 %: 21 000 Kč
• Celkem k úhradě: 121 000 Kč

Alfa s.r.o. si uplatní 21 000 Kč jako odpočet DPH a 100 000 Kč jako daňový náklad; vy zdaníte 100 000 Kč ve svém přiznání OSVČ. Protože cena odpovídá ceně obvyklé a služba je doložitelná (zadání, výkaz hodin, předaná aplikace), je transakce v pořádku.

Kdyby šlo o „odměnu za vedení firmy" nebo byste fakturovali 500 000 Kč za práci v hodnotě 100 000 Kč, hrozí překvalifikace a doměření daně.

• Fakturace výkonu funkce jednatele. Nejčastější omyl. Řízení firmy patří do smlouvy o výkonu funkce, ne na fakturu. Oddělte, co je funkce a co samostatná služba.
• Ignorování ceny obvyklé. U spojených osob nelze nastavit cenu „od oka". Doložte, jak jste k ceně došli (ceník, srovnatelné zakázky).
• Chybějící doložitelnost. Bez výkazu práce, zadání a výstupu působí faktura mezi vámi a vaší firmou účelově. Dokumentujte plnění.
• Prázdný popis plnění. „Konzultační služby 50 000 Kč" je pro finanční úřad červený hadr. Popisujte konkrétně.
• Přehlédnutý obrat pro DPH. Fakturace vlastní firmě se počítá do 2milionového limitu — hlídejte ho.
• Špatný režim u přeshraničního plnění. Účtování české DPH tam, kde patří reverse charge, znamená chybu na obou stranách.
• Záměna daní z peněz z firmy. Faktura, odměna jednatele, mzda a podíl na zisku mají různé daně a odvody. Zvolte kombinaci vědomě, ideálně s účetní.

doklad.ai je česká fakturace s AI, která vás situací „faktura vlastní s.r.o." provede bez chyb:

• Odběratele si uložíte jako stálý kontakt včetně IČO a DIČ — s.r.o. vytáhnete z registru a máte správné údaje na každé faktuře.
• Správná sazba DPH (21 % / 12 %) a režim se předvyplní; pro zahraniční odběratele nastavíte reverse charge včetně povinné doložky.
• Kompletní náležitosti — DUZP, evidenční číslo, popis plnění, rozpad základu daně a DPH — hlídá šablona, takže na nic nezapomenete.
• Opakované faktury za pravidelné služby vlastní firmě vystavíte automaticky.
• Přehled obratu vám pomůže sledovat 2milionový limit pro registraci k DPH.

Vystavte první fakturu vlastní s.r.o. během pár minut — [založte si účet na doklad.ai](https://doklad.ai) a mějte doklady i DPH v pořádku. Konkrétní daňové nastavení (odměna vs. faktura, cena obvyklá) vždy zkonzultujte s účetní.