Faktura jednateli a vlastní s.r.o.: kdy fakturovat jde a kdy ne

Jednatel svou vlastní s.r.o. fakturovat může, ale jen za činnost, která není výkonem funkce jednatele. Odměnu za vedení firmy (obchodní vedení, jednání za společnost, svolávání valné hromady) nelze převést na fakturu — patří do smlouvy o výkonu funkce a daní se jako závislá činnost podle § 6 zákona o daních z příjmů. Naopak jiné, věcně oddělitelné služby (např. vývoj softwaru, marketing, poradenství v jiném oboru) můžete své firmě fakturovat jako OSVČ nebo přes jinou společnost — musí ale jít o reálné plnění za cenu obvyklou, protože jste s vlastní s.r.o. spojené osoby. Níže najdete, kdy scénář nastává, co přesně na fakturu patří, jak funguje DPH a jak to vyřešit v doklad.ai.

Kdy tato situace nastává

Scénář „faktura jednateli / vlastní s.r.o." se objevuje v několika typických podobách:

Jste jednatel a zároveň OSVČ a chcete své s.r.o. fakturovat konkrétní práci (vývoj, grafika, konzultace), místo abyste si vypláceli odměnu jednatele nebo mzdu.
Máte dvě firmy — jedna poskytuje službu druhé, ve které jste rovněž jednatelem či společníkem (např. holdingové uspořádání, provozní a majetková společnost).
Rozjíždíte s.r.o. a řešíte, jak si z ní legálně vzít peníze: odměna jednatele, mzda, podíl na zisku, nebo faktura za služby.
Jste společník bez pracovní smlouvy, který pro firmu reálně pracuje na zakázkách mimo řízení společnosti.

Ve všech případech je klíčová jedna otázka: jde o výkon funkce jednatele, nebo o samostatnou službu? Odpověď určuje, zda vůbec smíte fakturovat a jaký daňový a odvodový režim se použije.

Co NELZE fakturovat: výkon funkce jednatele

Vztah mezi jednatelem a společností při výkonu funkce se řídí zákonem o obchodních korporacích, ne obchodní (dodavatelskou) smlouvou. Obchodní vedení firmy proto nelze fakturovat — odměna za funkci se sjednává ve smlouvě o výkonu funkce schválené valnou hromadou (jinak je funkce ze zákona bezplatná).

Co spadá pod výkon funkce a na fakturu nepatří:

obchodní vedení a organizace chodu společnosti,
jednání za společnost navenek (podpisy smluv, zastupování),
vedení účetní evidence po organizační stránce, svolávání valné hromady,
strategické řízení a rozhodování jednatele.

Daňový režim odměny jednatele: jde o příjem ze závislé činnosti podle § 6 ZDP. Odměnu zdaňuje společnost jako plátce (záloha na daň 15 %, u vysokých příjmů 23 %), odvádí se z ní zdravotní pojištění vždy a sociální pojištění, pokud odměna dosáhne rozhodné částky pro účast na nemocenském pojištění. Přesné hranice a sazby pro rok 2026 si ověřte u účetní nebo na webu ČSSZ a VZP — mění se každý rok.

Co LZE fakturovat: samostatné služby za cenu obvyklou

Pokud pro firmu děláte činnost, která věcně nesouvisí s řízením společnosti a dělal by ji stejně tak externí dodavatel, můžete ji své s.r.o. fakturovat — jako OSVČ nebo přes jinou firmu. Příklady: naprogramování e-shopu, správa PPC kampaní, právní či daňové poradenství (máte-li oprávnění), stavební práce, pronájem vlastního vybavení.

Musí být ale splněno:

Reálné plnění — služba se skutečně poskytla, je doložitelná (výstup, výkaz práce, předávací protokol). Fiktivní faktura je daňový podvod.
Cena obvyklá. S vlastní s.r.o. jste spojené osoby. Podle § 23 odst. 7 zákona o daních z příjmů musí cena mezi spojenými osobami odpovídat ceně, jakou byste sjednali s nezávislým subjektem. Nadhodnocená faktura (odčerpání zisku) i podhodnocená faktura může vést k doměření daně.
Živnostenské/jiné oprávnění na danou činnost, pokud ho obor vyžaduje.
Oddělitelnost od funkce jednatele. Čím blíž je služba k obchodnímu vedení, tím větší riziko, že finanční úřad plnění překvalifikuje na odměnu jednatele.

Dobře nastavená fakturace je legální a běžná. Hraniční je jen tehdy, když se za „službu" fakticky schovává výkon funkce nebo běžná závislá práce.

Režim DPH: tuzemsko, spojené osoby, přeshraničně

Oba jste čeští plátci DPH (nejčastější případ). Fakturuje se v běžném tuzemském režimu s českou DPH — základní sazba 21 %, snížená 12 % podle druhu plnění. Vaše s.r.o. si odpočte DPH na vstupu, pokud plnění použije pro svou ekonomickou činnost s nárokem na odpočet.

Pozor na § 36a — cena obvyklá i pro DPH. Protože jste se svou s.r.o. spojené osoby, u plnění, kde příjemce nemá plný nárok na odpočet (např. firma má i osvobozená plnění), se základ daně stanoví z ceny obvyklé, ne z ceny na faktuře. Pokud má vaše s.r.o. plný nárok na odpočet, tato korekce se typicky neuplatní, ale arm's-length cenu hlídejte kvůli dani z příjmů vždy.

Jste neplátce (OSVČ) a s.r.o. je plátce. Fakturujete bez DPH. Hlídejte si obrat: při překročení 2 000 000 Kč za 12 po sobě jdoucích měsíců vám vzniká povinnost registrace k DPH. Fakturace vlastní firmě se do obratu započítává.

Přeshraniční varianty (dle sídla stran):

Jste OSVČ/firma v jiném státě EU a fakturujete české s.r.o. — u služeb podle základního pravidla (§ 9) je místo plnění tam, kde sídlí příjemce. Fakturujete bez DPH s režimem přenesení daňové povinnosti (reverse charge), českou daň si přizná a odvede vaše s.r.o.
České s.r.o. jako příjemce služby ze třetí země (mimo EU) — obvykle rovněž reverse charge na straně příjemce.
Fakturujete z ČR do zahraničí — místo plnění a povinnost se řídí sídlem odběratele a typem plnění.

Přeshraniční řetězce a zvláštní plnění (nemovitosti, doprava, digitální služby) mají odchylná pravidla — u konkrétního případu doporučujeme ověření s účetní.

Náležitosti faktury a ukázkový příklad

Faktura vlastní s.r.o. má stejné náležitosti jako každý jiný daňový doklad. Nezapomeňte na:

označení dodavatele i odběratele včetně IČO a DIČ obou stran,
evidenční číslo dokladu, datum vystavení, datum uskutečnění zdanitelného plnění (DUZP) a datum splatnosti,
rozsah a předmět plnění popsaný konkrétně (ne jen „služby"),
jednotkovou cenu, základ daně, sazbu a výši DPH (u plátce), celkovou částku,
u reverse charge větu „daň odvede zákazník".

Ukázkový příklad (oba plátci DPH, tuzemsko):

Jste jednatel firmy Alfa s.r.o. a zároveň OSVČ – programátor. Firmě jste naprogramoval interní aplikaci. Obvyklá tržní cena takové zakázky je 100 000 Kč.

Předmět: „Vývoj interní skladové aplikace dle zadání ze dne …, 80 hodin"
Základ daně: 100 000 Kč
DPH 21 %: 21 000 Kč
Celkem k úhradě: 121 000 Kč

Alfa s.r.o. si uplatní 21 000 Kč jako odpočet DPH a 100 000 Kč jako daňový náklad; vy zdaníte 100 000 Kč ve svém přiznání OSVČ. Protože cena odpovídá ceně obvyklé a služba je doložitelná (zadání, výkaz hodin, předaná aplikace), je transakce v pořádku.

Kdyby šlo o „odměnu za vedení firmy" nebo byste fakturovali 500 000 Kč za práci v hodnotě 100 000 Kč, hrozí překvalifikace a doměření daně.

Časté chyby a jak se jim vyhnout

Fakturace výkonu funkce jednatele. Nejčastější omyl. Řízení firmy patří do smlouvy o výkonu funkce, ne na fakturu. Oddělte, co je funkce a co samostatná služba.
Ignorování ceny obvyklé. U spojených osob nelze nastavit cenu „od oka". Doložte, jak jste k ceně došli (ceník, srovnatelné zakázky).
Chybějící doložitelnost. Bez výkazu práce, zadání a výstupu působí faktura mezi vámi a vaší firmou účelově. Dokumentujte plnění.
Prázdný popis plnění. „Konzultační služby 50 000 Kč" je pro finanční úřad červený hadr. Popisujte konkrétně.
Přehlédnutý obrat pro DPH. Fakturace vlastní firmě se počítá do 2milionového limitu — hlídejte ho.
Špatný režim u přeshraničního plnění. Účtování české DPH tam, kde patří reverse charge, znamená chybu na obou stranách.
Záměna daní z peněz z firmy. Faktura, odměna jednatele, mzda a podíl na zisku mají různé daně a odvody. Zvolte kombinaci vědomě, ideálně s účetní.

Jak to vyřešíte v doklad.ai

doklad.ai je česká fakturace s AI, která vás situací „faktura vlastní s.r.o." provede bez chyb:

Odběratele si uložíte jako stálý kontakt včetně IČO a DIČ — s.r.o. vytáhnete z registru a máte správné údaje na každé faktuře.
Správná sazba DPH (21 % / 12 %) a režim se předvyplní; pro zahraniční odběratele nastavíte reverse charge včetně povinné doložky.
Kompletní náležitosti — DUZP, evidenční číslo, popis plnění, rozpad základu daně a DPH — hlídá šablona, takže na nic nezapomenete.
Opakované faktury za pravidelné služby vlastní firmě vystavíte automaticky.
Přehled obratu vám pomůže sledovat 2milionový limit pro registraci k DPH.

Vystavte první fakturu vlastní s.r.o. během pár minut — založte si účet na doklad.ai a mějte doklady i DPH v pořádku. Konkrétní daňové nastavení (odměna vs. faktura, cena obvyklá) vždy zkonzultujte s účetní.

Časté dotazy

Může jednatel fakturovat svou vlastní s.r.o.?

Za výkon funkce jednatele (obchodní vedení, jednání za firmu) ne — to patří do smlouvy o výkonu funkce a daní se jako závislá činnost. Jiné, věcně oddělitelné služby (vývoj, marketing, poradenství) fakturovat můžete jako OSVČ nebo přes jinou firmu, pokud jde o reálné plnění za cenu obvyklou.

Jaký je rozdíl mezi odměnou jednatele a fakturou za služby?

Odměna jednatele je příjem ze závislé činnosti podle § 6 ZDP — zdaňuje ji společnost a odvádí se z ní zdravotní (vždy) a při dosažení rozhodné částky i sociální pojištění. Faktura za samostatnou službu je běžný obchodní vztah: příjem zdaníte ve vlastním přiznání OSVČ nebo firmy. Nelze ale fakturou nahradit výkon funkce jednatele.

Musím u faktury vlastní firmě hlídat cenu obvyklou?

Ano. S vlastní s.r.o. jste spojené osoby a podle § 23 odst. 7 zákona o daních z příjmů musí cena odpovídat ceně sjednané mezi nezávislými subjekty. Nadhodnocená ani podhodnocená faktura neobstojí — riskujete doměření daně. Cenu doložte ceníkem nebo srovnatelnými zakázkami.

Jak je to s DPH mezi mnou a mou s.r.o.?

Jsou-li oba plátci a jde o tuzemské plnění, fakturuje se s českou DPH 21 % (nebo 12 %) a firma si odpočte daň na vstupu. U spojených osob platí § 36a: pokud příjemce nemá plný nárok na odpočet, základ daně se stanoví z ceny obvyklé. Přeshraniční služby v EU obvykle běží v režimu reverse charge.

Hrozí mi překlasifikace na odměnu jednatele nebo švarcsystém?

Ano, pokud za „službu" fakticky schováváte výkon funkce jednatele nebo běžnou závislou práci. Chraňte se tím, že fakturujete jen činnost oddělitelnou od řízení firmy, doložíte reálné plnění (zadání, výkaz, výstup) a použijete cenu obvyklou. Hraniční případy konzultujte s účetní nebo daňovým poradcem.